妖刀银河：新一的老爹优作莫名其妙把独子留在日本与老婆突然长期定居美国，肯定不是为了写小说，而是做其他事有可能是余那黑暗组织对立某个与黑暗组织势力相当的民间组织首领人物之一，或者优作也是黑暗组织领导人物中的另一派，从动画里可以看出那黑暗组织内部并不统一，柯南这么高调，要调查出他的身份是新一并不有多难，贝尔摩德做得到别人也做得到，但是以它小孩身躯没被组织追杀。化身柯南的新一与黑暗组织的斗争，或许是顺道考验新一未来能否担得起大组织领导人物的考验 发布于 2018-08-28 09:54:22

鹰火之队：这个脑洞有点大了。73说过阿笠博士如果是boss，那之前所有体现他美好的故事就都白费了，对于哀不也是一样吗，那样描写她的心理活动，让她一步步走出来 发布于 2018-08-27 14:19:07

8114249115：灰原哀到柯南身边卧底?哈哈哈哈哈哈，那你还不如直接说柯南是boss，灰原哀是保镖不就完事了 发布于 2018-08-27 14:09:02

张奇志是sb：真相是
乌丸莲耶创造的组织在暗中研究并饲养数码宝贝的时候，发现研制出的药(即aptx4869)对数码兽有些很神奇的功能，能使数码兽从完全体或究极体直接退化成幼年期
然而乌丸莲耶不小心吞下了a药并且变小了。他怕a药除了让他变小以外可能还有副作用，就让组织的人到处寻找非正常人类，灌药进行观察实验。而只要看过数码宝贝的人，吃完药后不论生死一律灭口。于是羽田浩司被灭口。阿曼达受牵连被屠杀。
而正因为a药对数码兽能起功效而对人并不是百分百有用，还有致死率。所以，除了专门研究a药的医学人员外，其他组织人员都称它为毒药。
当然，组织贯彻初心，对数码兽的研究还要继续保持下去，于是让宫野夫妇假死于火难，全身心投入到数码世界的研究。宫野厚司因为强迫给数码兽灌下a药，引起数码世界的不满，水办奥就在他身体里埋下了种子，让他变成了玄内老人→_→宫野艾莲娜穿梭于各个数码平行世界寻找解决方案
现实中，各个国家都害怕乌丸组织的研究，会将数码兽带入战争，于是各派遣卧底进入组织调查。组织虽然察觉到有卧底，但人数太多，还是反应不过来。
组织底层活动人员在第一话中当管家，看到某高中生侦探脚力惊人，不像正常人，于是向上层汇报，组织便派群演上演云霄飞车案件拖住工藤，伺机下毒。
后来，不出所料，组织成功了 发布于 2018-08-27 13:40:57

任务重大啊：……其他不管琴真不知道……杯户饭店差点毙了哀 发布于 2018-08-27 13:20:27

浅草轻踏：说是乌丸莲耶，但实际上乌丸莲耶是谁都不知道，后人继承先者的名字以及家业的也不是没有这种可能性，如果一直都是在暗地叫人做事的话，那面貌也只有亲信知道或者无人知道，都过了一个世纪谁又会记得乌丸莲耶长什么样。所以我觉得现在的乌丸莲耶可能不是死了的那个乌丸莲耶 发布于 2018-08-27 13:19:17

不醒醉：想太多了吧，组织又不是只研究aptx，一个半成品敢给boss吃？而且琴酒自己都不记得工藤新一这个人了 发布于 2018-08-27 03:20:27

曹谦子521：某新并没有触及到组织利益吧如果只是因为潜在威胁而下手未免也太… 发布于 2018-08-27 02:57:02

abl67：乌丸莲耶，日本大富豪，几乎可以肯定的是他就是现任boss ，因为73不可能大张旗鼓搞个前任boss出来，如果他真的140岁了那也可以肯定的是他吃了aptx或者其的前身，这意味着什么呢黑衣组织是一定知道aptx的真正用途的，至少琴酒肯定知道，那么琴酒的目的到底是什么，可以肯定游乐场事件远没想象那么简单，很有可能是故意设下的一个局，而那份名单有可能是混淆视听，还有雪莉这个人物要重新考量，很明显，如果真如上面所说，那么雪莉有可能是被故意放走的甚至还有更可怕的可能，这也能够解释柯南前期的种种根本解释不通的东西（比如琴酒那打开一半的箱子，再比如每一次知道小哀和
柯南的真实身份的成员连结论都没说就被琴酒给毙了） 发布于 2018-08-27 02:56:47

abl67：前排提示，这只是自己论断谢绝**，有可能有一些颠覆性的脑洞大家看看就好 发布于 2018-08-27 02:55:07

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